月経周期が24日以内の頻発月経、39日以上の稀発月経、月経がない無月経があります。
これらの原因の約70パーセントが脳の視床下部に問題があるといわれています。
視床下部に障害が起きると、性腺刺激ホルモンの分泌が正常に働かなくなり、
排卵しなかったり（無排卵）、遅延排卵が起こります。

視床下部の障害は、環境の変化や人間関係などによる精神的ストレスによって起こります。
身体に強いストレスがかかると大脳皮質が視床下部にブレーキをかけて不調を起こします。
例えば、無理なダイエットや激しい運動、不規則な生活などの生活習慣によっても起こります。
他に下垂体の機能の異常、卵巣の異常（ターナー症候群など）、甲状腺機能亢進症・低下症、薬の副作用でも起こります。